Trong sắt(III) perchlorat, vì ClO4− có khả năng phối hợp cực kỳ thấp, nó là một thuốc thử quan trọng để nghiên cứu muối sắt(III) ngậm nước.[5] Nó có thể thay thế các hợp chất sắt(III) khác để xác định phân tích, chẳng hạn như xác định hàm lượng chì(II) azua bằng phương pháp quang phổ sắt(III) perchlorat.[6]

Sắt(III) perchlorat cũng có thể thúc đẩy các phản ứng gốc tự do của fuleren, chẳng hạn như bổ sung gốc tự do C60 và β-ketoesters.[7]